Bộ môn Vi sinh - Ký sinh đảm nhiệm việc giảng dạy các môn học về sinh học của Khoa Dược và là một Bộ môn có nhiều đề tài nghiên cứu và hợp tác quốc tế.
Hiện nay Bộ môn gồm 14 nhân viên, trong đó Ban Giảng huấn gồm 1 Phó Giáo sư và 2 Tiến sĩ, 1 nghiên cứu sinh, 3 Thạc sĩ
Đào tạo trình độ đại học, Bộ môn giảng dạy các học phần Sinh học, Vi sinh học, Ký sinh trùng học, Công nghệ sinh học Dược, Sản xuất nguyên liệu làm thuốc bằng phương pháp sinh học. Hàng năm tiếp nhận khoảng 15 sinh viên làm khóa luận tốt nghiệp dược sĩ đại học.
Đào tạo trình độ sau đại học, Bộ môn giảng dạy các môn Sinh học phân tử, Dược phẩm sinh học và Kiểm nghiệm thuốc bằng phương pháp sinh học. Hàng năm có khoảng 5 học viên SĐH làm Luận văn và 2 Nghiên cứu sinh Tiến sĩ làm Luận án tại Bộ môn.
Các đơn vị nghiên cứu khoa học của Bộ môn gồm các Phòng thí nghiệm Công nghệ sinh học dược, Phòng thí nghiệm Vi sinh-Sinh học phân tử và Phòng thí nghiệm Vi nấm-Ký sinh trùng học.
Hoạt động nghiên cứu bao gồm các lĩnh vực như probiotic, thực phẩm chức năng, vi sinh phân tử, công nghệ gen, chẩn đoán và định danh dựa trên acid nucleic, enzym làm thuốc, màng sinh học trị bỏng, sàng lọc hoạt chất kháng khuẩn và kháng nấm mới, kiểm nghiệm sinh học,...
Các hoạt động nghiên cứu và đào tạo của Bộ môn đã được gắn kết chặt chẽ với các Công ty, Xí nghiệp dược phẩm trong nước, các cơ sở đào tạo trong và ngoài nước. Giảng viên và nhiều sinh viên thực hiện khoá luận từ Bộ môn đã đi học nâng cao trình độ ở các nước như Anh, Mỹ, Pháp, Ý, Đức, Nhật, Bỉ, Áo, Thái lan và Singapore.